sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-LN-A49R	1	61735	121741181	2	1
TCGA-LN-A49R	1	143285278	174822636	2	2
TCGA-LN-A49R	1	174824556	175165178	5	1
TCGA-LN-A49R	1	175168240	246338944	2	2
TCGA-LN-A49R	1	246343434	247092245	4	1
TCGA-LN-A49R	1	247096269	248930189	2	2
TCGA-LN-A49R	2	12784	132400270	2	2
TCGA-LN-A49R	2	132400703	132825224	4	2
TCGA-LN-A49R	2	132833556	136243362	2	2
TCGA-LN-A49R	2	136250373	136953306	4	1
TCGA-LN-A49R	2	136957689	225461266	2	2
TCGA-LN-A49R	2	225463145	226579310	5	2
TCGA-LN-A49R	2	226580333	242147305	2	1
TCGA-LN-A49R	3	18667	3767112	2	0
TCGA-LN-A49R	3	3767135	3821635	0	0
TCGA-LN-A49R	3	3823831	55670373	2	0
TCGA-LN-A49R	3	55671568	56207935	0	0
TCGA-LN-A49R	3	56208696	61044936	2	0
TCGA-LN-A49R	3	61045041	61141532	4	0
TCGA-LN-A49R	3	61141631	90253459	2	0
TCGA-LN-A49R	3	90253698	129415575	4	0
TCGA-LN-A49R	3	129415592	189586813	5	0
TCGA-LN-A49R	3	189587654	190032346	9	0
TCGA-LN-A49R	3	190032449	193572595	6	0
TCGA-LN-A49R	3	193572679	198169247	5	0
TCGA-LN-A49R	4	12281	44902236	2	0
TCGA-LN-A49R	4	44902254	51832470	3	0
TCGA-LN-A49R	4	51832591	52756464	5	2
TCGA-LN-A49R	4	52760476	52795973	1	0
TCGA-LN-A49R	4	52799822	53462101	2	0
TCGA-LN-A49R	4	53472949	56886569	3	2
TCGA-LN-A49R	4	56890030	57288770	8	2
TCGA-LN-A49R	4	57289879	57373844	2	0
TCGA-LN-A49R	4	57375326	60532605	2	2
TCGA-LN-A49R	4	60533220	64980933	3	2
TCGA-LN-A49R	4	64986185	65279601	8	2
TCGA-LN-A49R	4	65280319	71552100	2	1
TCGA-LN-A49R	4	71553235	73244332	3	3
TCGA-LN-A49R	4	73257421	73763039	8	2
TCGA-LN-A49R	4	73771141	74585708	4	3
TCGA-LN-A49R	4	74588991	74894250	2	1
TCGA-LN-A49R	4	74894730	75649270	2	0
TCGA-LN-A49R	4	75650862	76229931	5	2
TCGA-LN-A49R	4	76230321	76710272	12	2
TCGA-LN-A49R	4	76710734	78015023	2	0
TCGA-LN-A49R	4	78016968	78215104	2	1
TCGA-LN-A49R	4	78216411	190106768	2	0
TCGA-LN-A49R	5	15532	3123879	3	3
TCGA-LN-A49R	5	3124126	50230193	3	2
TCGA-LN-A49R	5	50247015	107924967	2	0
TCGA-LN-A49R	5	107925316	181363319	2	1
TCGA-LN-A49R	6	149661	20728282	2	2
TCGA-LN-A49R	6	20728500	20878423	1	0
TCGA-LN-A49R	6	20881668	20934227	0	0
TCGA-LN-A49R	6	20943217	21068833	2	0
TCGA-LN-A49R	6	21070245	26355370	2	2
TCGA-LN-A49R	6	26355511	45559485	2	1
TCGA-LN-A49R	6	45562018	45902684	2	0
TCGA-LN-A49R	6	45903319	48275914	2	1
TCGA-LN-A49R	6	48277725	50318344	2	2
TCGA-LN-A49R	6	50318389	50537094	9	3
TCGA-LN-A49R	6	50538471	55204196	2	1
TCGA-LN-A49R	6	55209476	60354473	2	0
TCGA-LN-A49R	6	60355929	61028778	2	1
TCGA-LN-A49R	6	61033822	62335115	2	2
TCGA-LN-A49R	6	62335862	63972357	2	1
TCGA-LN-A49R	6	63972500	64585796	3	3
TCGA-LN-A49R	6	64586267	64947343	9	2
TCGA-LN-A49R	6	64947487	66992123	3	3
TCGA-LN-A49R	6	66995037	69769617	3	2
TCGA-LN-A49R	6	69769880	71105241	5	2
TCGA-LN-A49R	6	71105615	72156821	2	2
TCGA-LN-A49R	6	72157169	124716342	2	0
TCGA-LN-A49R	6	124718466	125044817	4	0
TCGA-LN-A49R	6	125047328	170741917	2	0
TCGA-LN-A49R	7	43259	7274084	2	2
TCGA-LN-A49R	7	7274099	21398087	3	2
TCGA-LN-A49R	7	21398774	62526916	2	2
TCGA-LN-A49R	7	62526945	70944226	4	2
TCGA-LN-A49R	7	70944333	76903535	3	2
TCGA-LN-A49R	7	76903706	106766507	3	3
TCGA-LN-A49R	7	106766971	159334314	2	0
TCGA-LN-A49R	8	81254	46311184	2	1
TCGA-LN-A49R	8	46312772	112518702	2	2
TCGA-LN-A49R	8	112519402	116090892	5	3
TCGA-LN-A49R	8	116091117	145072769	4	2
TCGA-LN-A49R	9	46587	42995504	2	0
TCGA-LN-A49R	9	60840363	68420787	1	0
TCGA-LN-A49R	9	68421022	98782345	3	0
TCGA-LN-A49R	9	98788085	116605029	5	0
TCGA-LN-A49R	9	116606912	116905212	0	0
TCGA-LN-A49R	9	116906219	138200944	5	0
TCGA-LN-A49R	10	26823	38770504	3	3
TCGA-LN-A49R	10	38770824	53181641	2	0
TCGA-LN-A49R	10	53185673	53612257	5	0
TCGA-LN-A49R	10	53619971	133769379	2	0
TCGA-LN-A49R	11	198572	69012165	2	1
TCGA-LN-A49R	11	69017247	69037421	7	7
TCGA-LN-A49R	11	69039644	72282158	11	1
TCGA-LN-A49R	11	72284595	73915769	8	2
TCGA-LN-A49R	11	73915910	78994202	3	3
TCGA-LN-A49R	11	78995562	135074876	2	0
TCGA-LN-A49R	12	51460	8978569	2	2
TCGA-LN-A49R	12	8983755	34650111	3	2
TCGA-LN-A49R	12	34682719	91863357	2	2
TCGA-LN-A49R	12	91863733	95694528	2	1
TCGA-LN-A49R	12	95697577	96598096	4	1
TCGA-LN-A49R	12	96598687	106019480	2	1
TCGA-LN-A49R	12	106019844	133201603	4	1
TCGA-LN-A49R	13	18452809	72976671	2	0
TCGA-LN-A49R	13	72987490	74006179	5	0
TCGA-LN-A49R	13	74008955	114342922	2	0
TCGA-LN-A49R	14	18225647	106877229	2	1
TCGA-LN-A49R	15	19811075	42942888	2	1
TCGA-LN-A49R	15	42943259	45996377	3	2
TCGA-LN-A49R	15	45996741	101928837	2	2
TCGA-LN-A49R	16	10777	1511767	2	1
TCGA-LN-A49R	16	1514822	1703331	2	0
TCGA-LN-A49R	16	1703428	78584034	2	2
TCGA-LN-A49R	16	78587476	78966462	2	0
TCGA-LN-A49R	16	78968534	79023531	4	0
TCGA-LN-A49R	16	79023563	79557896	5	2
TCGA-LN-A49R	16	79558000	90221127	2	2
TCGA-LN-A49R	17	150733	5271064	2	0
TCGA-LN-A49R	17	5271496	9159447	6	0
TCGA-LN-A49R	17	9161025	9476430	4	0
TCGA-LN-A49R	17	9477504	14386230	6	0
TCGA-LN-A49R	17	14386839	27014516	4	0
TCGA-LN-A49R	17	27015487	68888738	2	2
TCGA-LN-A49R	17	68889231	71998586	3	2
TCGA-LN-A49R	17	71999508	83090856	2	2
TCGA-LN-A49R	18	48133	29862538	2	1
TCGA-LN-A49R	18	29862864	30559677	4	1
TCGA-LN-A49R	18	30561536	80257174	1	1
TCGA-LN-A49R	19	90910	27582051	2	2
TCGA-LN-A49R	19	27589514	58200763	2	1
TCGA-LN-A49R	19	58202407	58586487	2	2
TCGA-LN-A49R	20	80664	14554710	2	2
TCGA-LN-A49R	20	14560045	14781394	4	2
TCGA-LN-A49R	20	14781457	59678614	2	2
TCGA-LN-A49R	20	59678635	60315848	4	2
TCGA-LN-A49R	20	60315896	64324800	2	2
TCGA-LN-A49R	21	10336543	19837605	2	0
TCGA-LN-A49R	21	19840361	20392957	2	1
TCGA-LN-A49R	21	20393378	32089739	2	0
TCGA-LN-A49R	21	32090368	39855535	2	2
TCGA-LN-A49R	21	39859835	46677045	2	0
TCGA-LN-A49R	22	15294545	33756161	2	1
TCGA-LN-A49R	22	33758033	34571290	3	1
TCGA-LN-A49R	22	34572174	50796027	2	1
TCGA-LN-A49R	X	251810	57122357	1	0
TCGA-LN-A49R	X	57122461	57439034	0	0
TCGA-LN-A49R	X	57442714	58337694	1	0
TCGA-LN-A49R	X	58341779	93959775	2	0
TCGA-LN-A49R	X	93960481	94013267	1	0
TCGA-LN-A49R	X	94013732	156004181	2	0
