sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-BR-7703-a	1	61735	17686820	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	17687027	17781299	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	17783430	50549529	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	50552138	51295272	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	51299597	55228284	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	55229049	55515737	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	55518467	67385284	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	67386204	72708197	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	72708541	76878306	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	76879069	77074241	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	77078331	116316978	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	116322535	116800201	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	116802731	118644430	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	118649840	119379947	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	119380513	212046447	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	212046710	212707615	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	212708371	215766768	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	215770840	215973552	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	215978388	241744086	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	241750062	242153433	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	242158337	249224388	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	12784	30973002	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	30973825	31004365	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	31005176	75276429	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	75276730	76086909	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	76087145	83637055	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	83638070	84218291	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	84219168	150441261	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	150446083	151355526	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	151360083	181728139	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	181730174	182410691	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	182411446	213078748	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	213078788	214273906	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	214277559	218050665	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	218050827	218264304	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	218265325	243089456	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	60345	38648821	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	38652719	38870175	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	38870345	85874519	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	85879614	86230292	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	86234863	109003239	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	109003839	109322719	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	109324245	126601173	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	126608223	126661083	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	126661199	129921219	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	129929625	129997100	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	129999174	145219082	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	145226645	145295342	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	145295719	152590762	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	152590821	173029776	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	173029873	197896118	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	12281	194147	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	197946	2624103	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	2624208	98709930	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	98714323	99297253	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	99298979	110196995	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	110198260	111147663	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	111148330	127713504	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	127713633	127873952	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	127873979	146631131	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	146631407	147000414	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	147001249	184092883	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	184094760	184616779	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	184627810	191027923	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	15532	44257471	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	44258516	44393569	1	0
TCGA-BR-7703-a	5	44394595	50584804	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	50590006	50938825	1	0
TCGA-BR-7703-a	5	50938951	105426333	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	105427098	105661754	1	0
TCGA-BR-7703-a	5	105663499	160063380	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	160066666	160413717	1	0
TCGA-BR-7703-a	5	160413823	180790320	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	149661	6253546	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	6254703	6356698	1	0
TCGA-BR-7703-a	6	6357485	28059693	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	28059734	30726939	1	0
TCGA-BR-7703-a	6	30728360	55665115	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	55666014	55753933	1	0
TCGA-BR-7703-a	6	55754316	104840487	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	104842765	105724641	1	0
TCGA-BR-7703-a	6	105726036	171051005	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	43259	36196956	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	36197908	36395294	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	36398028	52431692	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	52432542	52830156	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	52830858	56914717	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	56914787	57750364	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	57753476	67532953	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	67535164	67890711	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	67891700	68629412	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	68629661	69676065	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	69679681	87992766	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	87997220	88337405	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	88340148	101333947	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	101341246	101904315	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	101904359	124142210	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	124146503	124198657	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	124198885	134189833	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	134192831	134478774	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	134480587	159127004	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	31254	17861356	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	17864017	18780426	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	18785183	39653983	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	39658219	40440599	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	40440779	64472977	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	64474170	64990530	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	64995489	76782308	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	76792827	79034933	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	79036777	109099144	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	109102299	109251083	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	109260581	146298155	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	46587	5454734	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	5454967	5639823	1	0
TCGA-BR-7703-a	9	5644555	72016151	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	72016570	72698039	1	0
TCGA-BR-7703-a	9	72698098	91530322	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	91530497	92243194	1	0
TCGA-BR-7703-a	9	92243399	128627315	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	128630511	129413298	1	0
TCGA-BR-7703-a	9	129416213	141091394	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	72759	15624941	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	15631351	16128633	1	0
TCGA-BR-7703-a	10	16132652	28652517	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	28652572	29240582	1	0
TCGA-BR-7703-a	10	29240754	58220681	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	58222110	59027273	1	0
TCGA-BR-7703-a	10	59027451	125712327	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	125725603	126117214	1	0
TCGA-BR-7703-a	10	126118342	135506704	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	198572	2454962	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	2455080	3632370	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	3633594	8912860	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	8917737	9064637	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	9065266	39285576	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	39285646	39652112	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	39652259	56105485	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	56106564	56417261	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	56419633	70410130	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	70420819	71794546	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	71794681	102266643	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	102270209	102826467	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	102826539	116333536	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	116336284	116427993	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	116429407	134944770	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	150442	22865243	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	22866862	23294460	1	0
TCGA-BR-7703-a	12	23297955	34854498	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	37857751	53944495	1	0
TCGA-BR-7703-a	12	53948773	54635734	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	54638729	54948783	1	0
TCGA-BR-7703-a	12	54952688	71547010	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	71547730	89282217	1	0
TCGA-BR-7703-a	12	89283762	133778189	1	1
TCGA-BR-7703-a	13	19026949	64954154	1	1
TCGA-BR-7703-a	13	64961626	65041154	1	0
TCGA-BR-7703-a	13	65042663	68345284	1	1
TCGA-BR-7703-a	13	68351307	69675312	1	0
TCGA-BR-7703-a	13	69675703	115108397	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	19002124	29334451	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	29336517	29977571	1	0
TCGA-BR-7703-a	14	29977959	40652144	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	40653248	40792600	1	0
TCGA-BR-7703-a	14	40793161	86721817	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	86726082	88352666	1	0
TCGA-BR-7703-a	14	88353310	98190404	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	98192042	98707648	1	0
TCGA-BR-7703-a	14	98710655	107285437	1	1
TCGA-BR-7703-a	15	20016328	24082716	1	1
TCGA-BR-7703-a	15	24082733	28141132	1	0
TCGA-BR-7703-a	15	28141304	98236603	1	1
TCGA-BR-7703-a	15	98240026	99348627	1	0
TCGA-BR-7703-a	15	99349080	102469040	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	60777	31938455	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	31938591	63957068	1	0
TCGA-BR-7703-a	16	63957332	75985571	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	75986352	77412274	1	0
TCGA-BR-7703-a	16	77413264	78260114	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	78262821	78372611	1	0
TCGA-BR-7703-a	16	78372846	78416841	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	78416930	78588571	1	0
TCGA-BR-7703-a	16	78591553	90287535	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	526	13432557	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	13434742	13945658	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	13945802	21057299	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	21065060	21328679	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	21330616	25869008	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	25869524	26216890	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	26221200	32058858	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	32060709	32797456	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	32799448	67633708	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	67634040	67757504	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	67758081	81049726	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	48133	3260113	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	3260600	3750642	1	0
TCGA-BR-7703-a	18	3753093	10305920	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	10310034	10492823	1	0
TCGA-BR-7703-a	18	10493077	20436874	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	20437002	21657374	1	0
TCGA-BR-7703-a	18	21657711	51054765	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	51054889	51899118	1	0
TCGA-BR-7703-a	18	51899514	78015057	1	1
TCGA-BR-7703-a	19	90910	59097854	1	1
TCGA-BR-7703-a	20	61305	39315766	1	1
TCGA-BR-7703-a	20	39324770	39769891	1	0
TCGA-BR-7703-a	20	39769975	62956153	1	1
TCGA-BR-7703-a	21	10736871	48096957	1	1
TCGA-BR-7703-a	22	16052528	35518124	1	1
TCGA-BR-7703-a	22	35520058	36210711	1	0
TCGA-BR-7703-a	22	36225454	51234455	1	1
TCGA-BR-7703-a	X	168477	702213	1	1
TCGA-BR-7703-a	X	725756	1539703	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	1539832	2461365	1	1
TCGA-BR-7703-a	X	2462136	2694240	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	2703391	3176492	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	3176527	44262009	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	44275014	44794968	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	44799138	77663305	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	77664428	77860918	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	77866487	104442766	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	104447903	104759162	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	104766076	148369607	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	148374830	148492934	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	148497572	155233846	1	0
